Кариотипирање је процес наручивања и упаривања свих хромозома који се налазе у организму како би се добио свеобухватан поглед на читаву хромозомску карту појединца.
Али хајде да прво будемо сигурни да разумемо шта су хромозоми на првом месту. Хромозоми су структуре које изгледају слично нитима које се налазе унутар језгра сваке од ваших телесних ћелија.
Свака структура хромозома садржи цео генетски информациони план вашег тела. Ово диктира начин на који је ваше тело структурирано, реагује на подражаје, предиспозиције за болести, итд. Жене имају 2 'Кс' хромозома, а мушкарци имају један 'Кс' и један 'И' хромозом. Свака ћелија вашег тела садржи 23 пара хромозома, укупно 46 хромозома.
Да би истраживачи могли да разумеју секвенце хромозома сваког пацијента, они користе софтвер за кариотипизацију . Овај тип софтвера је дизајниран да изврши анализу хромозома, и оцени структуру и број хромозома неке особе. На тај начин истраживачи и научници могу открити абнормалности.
У овом чланку ћемо истражити неке велике софтверске опције које вам омогућавају да извршите анализу кариотипа.
- 1
АргусСофт
АргусСофт је одлична софтверска опција која вам омогућава аутоматско кариотиповање људских хромозома по позицији бенда, а може се користити и за кариотипирање животиња и хромозома биљака на мрежи.
Кључне карактеристике:
- Г, К, Р бојење
- Аутоматизовано кариотипирање људских хромозома са препознавањем кривина
- Аутоматизовани кариотип кромосома свиња
- 3 уграђене основе стандардних идеограма људских хромозома са различитим нивоима чишћења - 400, 550 и 850 нивоа
- Може да дода базу стандардних кромосомских идеограма за друге животињске и биљне врсте
- Методе припреме узорака
- Унос метафазних плоча помоћу камере и скенера
- Пратите слику са графиком
- Аутоматска подела примењених и контактних хромозома
- Поређење хромозома и идеограма
Такође можете да користите АргусСофт да обучите систем препознавања хромозома користећи унапред подешене припреме, да пренесете слике метафазне плоче и кариограме у уграђену базу података, да направите обрасце извештаја, исправите кариограме и такође ускладиштите и штампате слике и резултате анализе.
Можете добити обуку и подршку за коришћење АргусСофт-а са њиховог званичног сајта. Центар за подршку укључује обуку, одржавање и консултантске услуге.
Покушајте АргусСофт
- 2
ХиБанд би Апплиед Спецтрал Имагинг
ХиБанд је софтвер створен од стране Апплиед Спецтрал Имагинг, који може извршити напредну анализу хромозома користећи дигиталне кариотипске функције. Овај софтвер
користи аутоматизоване функције скенирања за дубинску анализу структуре хромозома.
Можете користити широк спектар функција које се налазе у ХиБанду за индексирање, бројање, чување и управљање подацима о резултатима. Можете користити и овај моћан софтвер за аутоматско скенирање секвенце хромозома.
Резултати добијени употребом кариотипских функција пронађених ХиБанд-а могу се похранити на сигурном мјесту са заштићеним и заштићеним лозинкама. То вам омогућава безбрижност у вези губитка важних података о секвенцирању, а због тога и побољшава ефикасност ваше лабораторије.
Сортирање резултата се обавља на веома једноставан начин, само требате тражити одређени редослијед кромосома, а сви резултати се приказују на добро садржаном екрану који нуди једноставан приступ за измјену, преглед и додавање ознака било којој датотека.
Кључне карактеристике:
- Бригхтфиелд Кариотипинг-Г-Банд и Р-Банд
- Флуоресцентни кариотип-К-појас, Р-појас и ФИСХ
- Спецтрал Кариотипинг
- Аутоматско бројање хромозома
- Индексирање и класификација хромозома
- Напредна сепарација хромозома и напредно побољшање слике
- Галерија слика - може приказати све случајне метафазе и кариотипове на једном екрану
- Може да упореди хромозоме - види их раме уз раме
- Абберант Идеограм - у генератор слике можете додати хромозоме, ћелије, идеограме и анотације
ХиБанд користи потпуно аутоматизоване радне процесе за повећање ефикасности лабораторија, има функције за скенирање "старт-анд-валк-аваи", проналази метафазе, аутоматски чита бар кодове, преноси слике у реалном времену током скенирања слајдова и такође извози у лабораторију ЛИС Централ Портал и База података.
Покушајте ХиБанд
- 3
Икарос би МетаСистемс
Овај кариотипинг систем има веома интуитиван кориснички интерфејс који нуди све функције на једном екрану. То омогућава једноставан и брз приступ свим добијеним информацијама.
Икарос се може користити са Неоном, који је платформа дизајнирана да помогне са сликовним подацима и организацијом случаја. Неон сакупља податке са свих послова снимања, спољних извора и омогућава вам да их представите на лак начин за разумевање помоћу контролне табле за управљање предметима.
Овај алат вам омогућава да увек имате при руци важне информације и да их чувате на сигуран начин, али користи веома јаке алгоритме за управљање подацима, има лепе могућности за праћење података и може да пружи специфичне претраге на основу кључних речи и карактеристика података.
Погледајте више информација о Неону и његовим карактеристикама овде .
Икарос подржава различите технике везивања - Бригхтфиелд Г-Банд и Р-Банд, Флуоресценција К-Банд, Р-Банд и ФИСХ -, нуди велики број предефинисаних кариограмских облика за људе, биљке и животиње. Можете једноставно уредити ове обрасце да бисте додали било какве податке потребне за врсту истраживања које радите.
Чињеница да можете да упоредите хромозоме класом или кариограмима, нуди вам веома корисне информације које вам омогућавају да лако идентификујете разлике.
Пробај Икарос
- 4
МетаЦласс би Мицроптиц
МетаЦласс је одличан кариотиопинг софтвер који је дизајниран модуларно. Овај софтвер вам помаже да извршите кариотипирање и ФИСХ студије хромозома.
МетаЦласс се формира из следећих модула:
- МетаЦласс Датабасе
База података која се може инсталирати са било којим од модула МетаЦласс-а. Омогућава вам да чувате детаље о пацијенту и даје вам лак приступ резултатима. Помоћу овог модула можете креирати прилагођене извештаје на било ком језику.
- МетаЦласс Кариотипинг
Омогућава вам да проучавате кариотип након што су слике фазе припреме метафазе дигитално снимљене, и распоредите их у парове на основу величине, положаја, итд. Овај модул вам даје одличне резултате квалитета када су у питању хромозомске траке, а такође може пружити вам професионалне извештаје.
Главне карактеристике укључују:
- Проучавање кариотипа анализирано је под увећањем светлог поља 100Кс
- Може снимити неколико метафазних слика
- Квалитет слике је подесив за оштрије резултате
- Аутоматска класификација хромозома
- 4 екрана - прозор Метапхасе, Кариотипе и Унцлассифиед цхромосомес
- Може приказати прототипове хромозома
- Хромозоми који нису класификовани могу се аутоматски или ручно исправити - суперпозиције, сепарације, укрштања, ротације итд.
- Датотеке МТЦ сесије или БМП слике могу бити спремљене и поново учитане у било које вријеме
- Може извести појединачне хромозоме у базу Метацласс са могућношћу додавања коментара и напомена
Ево примера Метацласс кариотипинг извештаја.
- МетаЦласс ФИСХ
Ово је модул за анализу који вам омогућава да добијете слику флуоресцентне ИН СИТУ хибридизације (ФИСХ). Овај модул бележи слике помоћу флуоресцентних ДНК сонди, и омогућава вам да потврдите генетске абнормалности - трисомије, мокроделиције, промене кромосома, итд.
ФИСХ слике се анализирају под увећањем од 100к и за шири спектар јасноће слике, такође могу снимити слике са различитим филтерима.
Ако сте заинтересовани да сазнате више информација о горе наведеним модулима и другим могућностима, можете погледати каталог МетаЦласс.
Ако сте радознали тип и желите да видите извештај добијен коришћењем ФИСХ методе, можете
пример ПДФ фајла.Покушајте МетаЦласс
- 5
ГенАСис Бандвиев
ГенАСис Бандвиев је још један одличан кариотипинг софтвер који је изграђен од модула са различитим капацитетима. Ову апликацију можете да користите за дијагностику кариотипа и добијање тачних резултата теста.
Овај софтвер вам омогућава да у потпуности прилагодите ток рада и процес дијагнозе, у зависности од потреба ваше компаније и циљева које покушавате да постигнете.
Широк спектар алата обезбеђених у програму БандВиев лако је доступан само једним кликом миша и нуди моћно Г / Р / Ц / К-Банд кариотипинг искуство. Можете бирати између аутоматског или ручног тока рада када је у питању лоцирање метафаза и снимање слика.
Абнормалности хромозома, ако се нађу, могу се посматрати путем додавања, брисања или преуређивања генетског материјала пацијента. Са БандВиевом, можете користити бенд ФИСХ молекуларне технике.
ФИСХ користи флуоресцентне сонде да се веже на различите делове хромозома, омогућавајући софтверу да детектује и локализује абнормалите који се налазе у специфичним секвенцама ДНК.
Покушајте ГенАСис Бандвиев
Закључак
У овом чланку, истражили смо неке од најбољих аутоматизованих софтвера за кариотипизацију који постоје на тржишту крајем 2018. године.
Софтверске опције кариопирања које су описане у овом чланку нуде вам различите могућности које ће вам помоћи да постигнете циљеве ваше компаније.
Користећи ову врсту софтвера можете пребројати хиљаде хромозомских структура брзо, анализирати различитим професионалним техникама и произвести квалитетне извјештаје који ће вам омогућити да лако откријете било какве абнормалности.
Волели бисмо да сазнамо ваше мишљење о софтверу који смо представили на овој топ 5 листи. Слободно нам јавите помоћу одељка за коментаре испод.
ПОВЕЗАНИ ВОДИЧИ КОЈИ ТРЕБА ДА ПРОВЕРИТЕ:
- Требате софтвер за истраживање за академска истраживања? Ево 5 алата
- 5 најбољи софтвер за академско писање
- 10 најбољих софтвера за плагирање за откривање садржаја копирања у 2019. години
